Un investigador de la Universidad de Waterloo ha llevado a cabo el desarrollo de una nueva herramienta de software que puede determinar respuestas convincentes a algunas de las preguntas más fascinantes del mundo.
El software fusiona el aprendizaje automático supervisado (ML) con el procesamiento de señales digitales (DSP). La herramienta podría ser capaz de responder preguntas tales como cuántas especies diferentes existen en la Tierra o en los mares, cómo se relacionan las especies recién descubiertas y obsoletas, cuáles son los orígenes bacterianos del ADN mitocondrial humano, e incluso con la materia de un ADN. Parásito que tiene la misma firma genómica que su huésped.
Los investigadores consideran que el programa de software tiene un gran potencial al reconocer y etiquetar la cepa precisa de un virus, lo que afecta a la industria de la medicina personalizada de manera positiva al permitir la creación y prescripción de medicamentos específicos para tratar el virus.
La forma en que funciona ML-DSP, una herramienta de software libre de alineación, consiste en convertir una sección de ADN en señales numéricas digitales que luego se procesan y categorizan a través de métodos de procesamiento de señales digitales.
La nueva herramienta de software ahora puede responder las preguntas más fascinantes del mundo
Lila Kari, profesora de la Facultad de Matemáticas de Waterloo, dijo que la herramienta les permite clasificar las secciones de ADN incluso si son fragmentos pequeños e indiferentes de su origen, ya sean naturales, sintéticos o generados por computadora.
Los investigadores han realizado una comparación significativa con otros programas de software de clasificación de vanguardia en dos conjuntos de datos de puntos de referencia pequeños y un gran conjunto de datos de genoma mitocondrial de 4.322 vertebrados en el estudio.
Sus resultados concluyeron que el ML-DSP supera poderosamente al software basado en la alineación cuando se trata de su tiempo de procesamiento, teniendo precisiones de clasificación que son dignas de comparación en el caso de conjuntos de datos pequeños pero muy superiores cuando se trata de conjuntos de datos grandes.
Entonces, cuando lo comparamos con otras herramientas de software libres de alineación, ML-DSP tiene una mejor precisión de clasificación prevaleciente y en general es más rápido. Los investigadores también han liderado experimentos previos que demuestran el potencial de ML-DSP para ser utilizados para otros conjuntos de datos, al dividir 4,271 genomas completos del virus del dengue en subtipos con una precisión del 100 por ciento, y 4,710 genomas bacterianos en categorías con 95,5 por ciento de precisión.
Fecha actualización el 2021-04-18. Fecha publicación el 2019-04-18. Categoría: herramientas Autor: Oscar olg Mapa del sitio Fuente: newslair Version movil